Фамилия Чоботарева — женская форма фамилии Чоботарев, и её происхождение напрямую связано с ремеслом. В основе лежит слово «чобот», которое в старых русских говорах, особенно южных и западных, означало сапог, башмак, а иногда и просто грубую кожаную обувь. Соответственно, «чоботарь» — это сапожник, мастер по шитью обуви. Фамилия образована по самой распространённой модели: от названия профессии с помощью суффикса -арь (чоботарь) и далее — патронимического суффикса -ев, указывающего на принадлежность: «сын чоботаря», то есть Чоботарев.

Интересно, что слово «чобот» и его производные — не общеславянские, а имеют тюркские корни. В тюркских языках «чабата» или «чобот» означало вид обуви, часто плетёной или кожаной. В русский язык это слово пришло, скорее всего, через украинское и белорусское посредничество, где «чоботи» — распространённое обозначение сапог. Поэтому фамилия Чоботарев (и Чоботарева) особенно характерна для южнорусских областей, Украины и Белоруссии. В центральной и северной России сапожника чаще называли «сапожник» или «швец», так что здесь фамилия встречается реже и указывает на возможное переселение предков с юга.

В написании фамилии возможны варианты. Встречается написание через «ё» — Чёботарев, что отражает произношение в некоторых говорах, где «чобот» звучало как «чёбот». Оба варианта считаются правильными и восходят к одному корню, но форма с «ё» более редкая и часто указывает на локальную диалектную особенность. Таким образом, предки человека с фамилией Чоботарева в большинстве случаев были ремесленниками-сапожниками, жившими в южных или западных регионах России или на территории современной Украины.