Фамилия Данкенен — редкий и неочевидный случай для русского ономастикона. В ней нет славянских суффиксов (-ов, -ин, -ский), а окончание -ен скорее указывает на германское или финское происхождение. Скорее всего, перед нами вариант фамилии Дункен (Duncken) или Данкен (Danken), адаптированный под русскую письменность.

Самая правдоподобная версия возводит основу к немецкому или шотландскому корню. В немецком языке «danken» означает «благодарить». Фамилия могла возникнуть как прозвище благодарного, обязательного человека или, наоборот, как ироничное именование того, кто постоянно требовал благодарности. В Шотландии и Северной Англии фамилия Duncan (Данкан) широко распространена, но русская форма Данкенен явно вторична: двойной суффикс -ен-ен — это калька с немецкого -en, к которому добавили русское фамильное окончание -ен (как в фамилиях Шульцен, Брюгген).

Вторая версия, менее вероятная, — финская. В прибалтийско-финских языках есть слово «tankki» (амбар, хранилище) или личное имя Tanko. Через шведское посредничество фамилия могла попасть в среду ингерманландских финнов, а затем — в русские метрики.

Географически носители фамилии Данкенен встречаются в основном в Санкт-Петербурге, Ленинградской области и Карелии. Это типичный ареал расселения потомков финнов-ингерманландцев и немецких колонистов, живших на южном побережье Финского залива. В XIX веке такие фамилии нередко записывали со слуха, поэтому варианты «Данкенен», «Данкен» и «Данкененн» могли сосуществовать в одной семье.

Словообразовательная модель проста: корень Dank- плюс суффикс -en (принадлежность), который в русской передаче получил второе -ен, превратив фамилию в подобие славянского патронима. На деле это типичный случай, когда заимствованная фамилия обрастает лишними окончаниями, чтобы вписаться в привычную систему.