Фамилия Данькина образована от имени, а не от прозвища или профессии. В её основе лежит краткая разговорная форма крестильного мужского имени Даниил — Данька. Имя Даниил пришло в русский язык из древнееврейского и означает «мой судья — бог». Такое уменьшительное имя было естественным в быту: Данькой в семье называли ребёнка, а позже — и взрослого человека в кругу близких.

Фамилия Данькина — женская форма, а мужская будет Данькин. Обе они относятся к самой массовой модели русских фамилий на -ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Данькин буквально значит «сын Даньки» или «из семьи Даньки». Такие фамилии чаще всего возникали в среде, где не было строгой сословной иерархии и отчество быстро переходило в фамилию. Поэтому, скорее всего, основатель рода Данькиных был выходцем из рабочей или крестьянской среды, где имя Даниил было распространённым, а его просторечная форма — естественной.

От того же корня образованы фамилии Данилов, Данилин, Данильченко, но Данькина стоит особняком: она сохранила именно ту разговорную, «домашнюю» версию имени, которая реже становилась официальной фамилией. Это делает её более редкой и указывает на то, что предки, вероятно, жили в среде, где закреплялись именно обиходные прозвищные формы. В написании фамилии нет вариантов: окончание -ина — стандартный показатель женского рода, и его не путают с окончанием -ино, которое встречается у топонимов.