Фамилия Дейнекин — типичный пример того, как прозвище превратилось в родовое имя через простую и понятную модель. В основе лежит слово «дейнека». В XVII веке так называли украинского казака, вооружённого дубиной (от тюркского «дайнак» — дубина, палица). Прозвище указывало не столько на внешность, сколько на социальное положение и род занятий: предок, скорее всего, принадлежал к казачеству — военному сословию, которое в России XVIII — начала XX века использовалось для охраны границ и участия в войнах.

Фамилия образована по продуктивной русской модели с суффиксом -ин. Она отвечает на вопрос «чей?»: Дейнекин — значит сын или потомок Дейнеки. Такая форма характерна для фамилий, произошедших от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а или -я (ср. Пушкин, Репин, Ильин). Притяжательный суффикс закрепился в качестве фамильного, когда прозвище перестало быть личным и стало наследственным.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно — процесс формирования фамилий у казачества и крестьянства шёл неравномерно и растянулся на несколько столетий. Однако ясно, что фамилия Дейнекин несёт отпечаток военной и пограничной культуры южнорусских и украинских земель. Это не дворянская фамилия в классическом смысле, а скорее родовое имя из среды вольных или служилых людей, чья жизнь была связана с оружием и защитой рубежей.