Фамилия Догдонов — один из тех редких случаев, когда основа слова не поддаётся однозначной славянской этимологии. В ней нет ни очевидного корня, связанного с ремеслом или внешностью, ни привычного имени в основе. Всё указывает на то, что перед нами фамилия, возникшая на стыке культур, скорее всего, в среде бурятских или монгольских родов, перешедших в русское подданство и получивших фамилию по русской модели.

Словообразовательная форма здесь прозрачна: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), а основа — Догдон. Это личное имя или прозвище, которое в тюрко-монгольских языках могло иметь несколько значений. Наиболее вероятная версия — связь с монгольским «догдон» (или «догшин»), что переводится как «яростный», «свирепый», «грозный». В бурятском языке есть слово «догдо» — «гневный», «сердитый». Таким образом, Догдон — это, скорее всего, прозвище человека с крутым нравом, воина или охотника, которого боялись и уважали.

Есть и другая, менее распространённая гипотеза: возведение к буддийскому имени Догдон, которое в тибетской традиции означает «держатель копья» или «защитник». Это имя могли давать в дацанах, и оно могло перейти в светскую среду, закрепившись за родом. В любом случае, фамилия Догдонов — не случайный звуковой набор, а точный маркер этнического и социального происхождения: её носители — потомки людей из монголоязычного мира, которые приняли русскую фамильную систему, сохранив в основе родовое или личное имя.

Географически фамилия почти не встречается за пределами Восточной Сибири и Забайкалья — это типичная региональная фамилия. В отличие от массовых русских фамилий на -ов, которые образуются от тысяч разных основ, Догдонов остаётся локальной и редкой. Это не значит, что она «неправильная» или «чужая» — наоборот, она показывает, как русский суффикс присоединился к нерусской основе, и получилась фамилия, которая звучит по-русски, но хранит память о степных предках.