Фамилия Долгинский — одна из тех, что образована по типичной для шляхетских и духовных фамилий модели на «-ский». Это окончание указывает на происхождение либо от названия местности (топоним), либо от поместья, владельцем которого был предок. В русском контексте фамилии на «-ский» до XVIII века были характерны для польской шляхты и малороссийской старшины, а позже закрепились за духовенством (семинарские фамилии). Долгинский — не исключение.

Самая вероятная версия — географическая. Основа «Долгин-» восходит к названию населённого пункта: Долгое, Долгий, Долгиново, Долгинка. Таких топонимов на восточнославянских землях десятки — от Белоруссии до Сибири. Самое известное — местечко Долгиново (ныне в Минской области Белоруссии), которое в XVII–XVIII веках было частным владением. Человек, переселившийся оттуда, получал прозвание Долгинский, то есть «тот, кто из Долгинова». В польской ономастике это обычный способ образования фамилий для мелкой шляхты, которая брала фамилию по названию своего имения или деревни.

Вторая версия, менее распространённая, но не лишённая оснований, — происхождение от прозвища Долгий («высокий, долговязый»). В таком случае Долгинский — это вторичная форма, возникшая через прибавление суффикса «-ин-» и окончания «-ский». Подобное встречается: прозвище Долгий → Долгин → Долгинский. Однако такая цепочка менее типична: обычно от прозвищ на «-ий» образовывали фамилии на «-ов» (Долгов), а не на «-ский». Поэтому версия с топонимом выглядит убедительнее.

Словарь Б. Унбегауна «Русские фамилии» относит фамилии на «-ский» к числу тех, что в России долго сохраняли «книжный» или «дворянский» оттенок. Долгинские не были массовой фамилией — она редкая, сконцентрированная в основном на западе бывшей Российской империи: в Белоруссии, на Смоленщине, в западных областях Украины. Встречается она и среди еврейского населения черты оседлости, где фамилии на «-ский» нередко давали по названию местечка (например, Долгиново было еврейским местечком). Таким образом, носитель фамилии Долгинский с высокой вероятностью происходит из семьи, либо владевшей землёй в окрестностях Долгинова, либо жившей в этом местечке и получившей фамилию при переписи.

Написание фамилии устойчивое: ударение на втором слоге — Долги́нский. Вариант Долгинской (женский род) в быту встречается, но исторически правильная форма для мужчины — Долгинский. Если искать однокоренные фамилии, то к ним относятся Долгов, Долгих, Долгушин, а также польские Длугош и Длуги — все они восходят к тому же корню «долг-» в значении «длинный, высокий».