Фамилия Долынин образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность. Этот суффикс добавляется к основам, оканчивающимся на -а или -я. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Долыня. Вопрос в том, что оно означало.

Самая прямая и правдоподобная версия связывает прозвище Долыня с диалектным словом «долыня» — так в некоторых русских говорах называли человека, который живёт в долине, в низине, «в долу». Прозвище давалось по месту жительства: предок рода Долыниных мог быть выходцем из низинной местности или жителем села, расположенного в лощине. В отличие от фамилий, образованных от названий профессий, эта указывает скорее на ландшафтную привязку. Она встречается в центральных и южных областях России, где рельеф более разнообразен.

Менее распространённая, но не лишённая оснований гипотеза связывает основу с глаголом «долынить» — устаревшим словом со значением «упрямиться, делать назло» или «медлить, тянуть время». В этом случае Долыня — прозвище по характеру: упрямый, своенравный человек. Такие прозвища на Руси давали не в осуждение, а для точного узнавания, и они часто становились фамилиями. Однако в словарях русских говоров это значение фиксируется реже, чем «житель долины», поэтому версия с местом жительства выглядит убедительнее.

Стоит обратить внимание на отсутствие типичного для многих фамилий «переходного» варианта вроде Долынов. Суффикс -ин указывает на то, что исходное имя или прозвище Долыня было в обиходе, а не на отчество от имени Долын (мужского). Это говорит о том, что фамилия возникла в среде, где прозвища на -я были обычны, — скорее всего, в крестьянской или мещанской среде, где официальные метрики закрепляли уличные клички.

В итоге: фамилия Долынин — отчество от прозвища Долыня, которое, вероятнее всего, означало «живущий в долине». Это не редкая, но и не самая частая фамилия, и её носители могут с высокой долей уверенности связывать свои корни с сельской местностью средней полосы России.