Фамилия Доркунов — один из тех случаев, когда внешне прозрачная основа ставит перед исследователем несколько возможных путей, и каждый из них по-своему интересен. На первый взгляд, в ней слышится отголосок слова «доркать» (дёргать, толкать, бить), которое в русских говорах имело и более конкретное значение — «стучать, колотить». Отсюда могло возникнуть прозвище Доркун для человека суетливого, непоседливого или, напротив, того, кто работал с шумом, например, плотника или кузнеца. Однако это лишь одна версия.

Более убедительной выглядит связь с диалектным словом «доркун» — так в некоторых областях называли воробья или другую мелкую птицу, издающую отрывистые звуки. Прозвища по птичьему крику или повадкам — распространённое явление в русской ономастике: Воробьёв, Соловьёв, Чижов. Доркун в этом ряду — редкий и яркий пример, когда за основу взяли не общеупотребительное название, а местное, звукоподражательное. Человек, получивший такое прозвище, мог быть невысоким, юрким или обладать звонким, отрывистым голосом.

Морфология фамилии стандартна: суффикс -ов указывает на принадлежность, то есть Доркунов — сын или потомок Доркуна. Модель образования — патронимическая, типичная для центральной России и Поволжья. Фамилия не относится к числу частых, поэтому её география может быть локальной: скорее всего, она зародилась в среде северных или центральных говоров, где слово «доркун» сохранялось дольше всего. Встречаются и однокоренные фамилии — Доркушин, Доркачёв, — но Доркунов стоит особняком из-за суффикса -ун, который в прозвищах часто придавал оттенок активного действия или характерного признака (ср. Болтун, Говорун, Крикун).

Версия о происхождении от имени Дорка (уменьшительное от Дорофей или Дормидонт) менее вероятна: в таком случае фамилия имела бы форму Доркин или Дорков, а не Доркунов. Суффикс -ун в основе указывает именно на прозвище, а не на сокращённое каноническое имя. Таким образом, предки современных Доркунов, скорее всего, получили свою фамилию от живого, образного прозвища, за которым стояла какая-то яркая черта — будь то голос, характер или род занятий.