Фамилия Дрофина образована от мирского имени или прозвища Дрофа. В основе лежит название крупной степной птицы — дрофы. Эта птица известна тем, что при опасности предпочитает не взлетать, а убегать, развивая на сильных ногах высокую скорость.

Имя Дрофа могли дать ребёнку по языческой традиции: считалось, что, назвав младенца в честь животного или птицы, родители передают ему качества этого существа. Мальчик с таким именем должен был вырасти быстрым, выносливым и осторожным, как сама дрофа. Второй, не менее вероятный путь происхождения фамилии — от прозвища. Прозвище Дрофа мог получить проворный, резвый человек, который, по замечанию окружающих, «бегал, как дрофа».

Фамилия следует типичной для русского языка модели: к основе на -а присоединён суффикс принадлежности -ин. Дрофина буквально означает «дочь (или жена) Дрофы» — то есть человека по имени или прозвищу Дрофа. Ударение в фамилии падает на второй слог: Дро́фина.

Фамилия довольно редкая. Её географическое распространение связано с южными, степными регионами России и Украины — там, где водится дрофа и где такое прозвище было бы понятным и естественным для окружающих. Встречается она и в казачьих областях, где мирские имена и прозвища сохранялись дольше, чем в центральных губерниях.