Фамилия Дрожжиновы образована от прозвища Дрожжи, корень которого — нарицательное «дрожжи» (вещество из микроскопических грибков, вызывающее брожение). Слово общеславянское, родственное польскому drożdże и чешскому droždí, что указывает на древность основы. Прозвище Дрожжи могли дать человеку, который варил брагу, пиво или квас — то есть занимался брожением профессионально. В крестьянском быту такое занятие было распространённым, но не повседневным: варка хмельных напитков часто выделяла мастера среди односельчан. Возможен и переносный смысл: «дрожжами» в говорах иногда называли суетливого, беспокойного человека (от глагола «дрожать»), но эта версия менее убедительна — в основе фамилий чаще лежит конкретное ремесло, чем отвлечённая черта.

Суффикс -ов- указывает на стандартную русскую патронимическую модель: Дрожжинов буквально значит «сын Дрожжи». Окончание -ы в форме множественного числа (Дрожжиновы) типично для фамилий, закрепившихся в качестве родового имени семьи, особенно в старообрядческой и севернорусской среде. Встречаются варианты написания: Дрожжин (с усечением -ов) и Дрожжев (с чередованием ж/жж), но Дрожжинов — более архаичная форма, сохранившая полную основу.

Точное место возникновения фамилии не установлено, но география бытования узкая: фамилия редкая, встречается в основном в центральных и северных областях России, единично — на Урале. В дореволюционных переписях не фиксируется среди дворянских родов, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение. Среди носителей фамилии нет известных исторических деятелей, но она представляет собой живой след ремесленной культуры: прозвище Дрожжи могло передаваться как внутрисемейное имя ещё до закрепления фамилии, что характерно для русских родов, чьи предки занимались пивоварением или квасоварением.