Фамилия Дубра образована от прозвища, которое указывало на место жительства родоначальника. В основе лежит славянское слово dǫbrъ — «дубовый лес», «дубрава». Человек с таким прозвищем жил среди дубов, в дубовом лесу или рядом с ним.

Сам корень несёт древнюю символику. У славян дуб связывали с образом громовержца Перуна: это дерево служило местом для жертвоприношений и почиталось священным. Фамилия сохранила память не только о географическом объекте, но и об архаичных верованиях.

По словообразовательной модели фамилия относится к редкому типу. В ней нет патронимических суффиксов (-ов, -ин, -ский), которые в русской традиции присоединяли к основе, чтобы указать на принадлежность «чей сын?». Вместо этого прозвище Дубр или Дубра перешло в фамилию в чистом виде, без оформления окончанием. Такая модель встречается в основном у украинских, белорусских и южнорусских фамилий, где усечение суффикса — обычное явление. Если бы фамилия закрепилась в северных великорусских говорах, она скорее приняла бы форму Дубров или Дубравин.

Версия о происхождении от слова «дубрава» — основная. Альтернативных гипотез, например от личного имени или тюркского корня, для этой фамилии нет: звуковой облик и география бытования (западные и южные регионы) указывают именно на славянский природный объект.