Фамилия Дуняшев — редкий случай, когда за основу взято женское имя. В большинстве русских фамилий на -ев корень — мужское имя или прозвище, но здесь исходная форма — Дуняша, уменьшительно-ласкательный вариант имени Евдокия (в просторечии также Авдотья). Евдокия — греческое имя, означающее «благоволение», но в быту оно давно утратило связь с переводом и воспринималось как обычное русское имя. Суффикс -ев указывает на притяжательное значение: Дуняшев буквально значит «чей?» — сын или потомок Дуняши.

Это нестандартная модель. Обычно фамилии от женских имён возникали, когда женщина оставалась единственной кормилицей или главой дома после смерти мужа, либо в ситуации внебрачного рождения, когда отцовство не фиксировали. В крестьянской среде XVII–XIX веков так могли записать ребёнка вдовы Евдокии или Авдотьи, которую в деревне звали Дуняшей. Фамилия закрепилась за потомками, и уже через поколение никто не вспоминал, что основа — женская.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным губерниям России: Тамбовской, Рязанской, Воронежской, Пензенской. В этих местах имя Евдокия было особенно популярно среди крестьян, а формы Дуня и Дуняша — самыми распространёнными бытовыми вариантами. Встречаемость фамилии невысокая, что объясняется именно механизмом образования: женские основы в фамилиях давали гораздо меньше производных, чем мужские.

Интересно, что параллельно существует фамилия Дуняшин — с суффиксом -ин, что характерно для основ на -а/-я. В случае Дуняшев суффикс -ев возник из-за того, что основа Дуняш в косвенных падежах звучала как Дуняша, и притяжательная форма по аналогии с мужскими именами (Иваш — Ивашев) дала -ев. Это говорит о том, что фамилия складывалась в устной традиции, без строгого следования грамматическим правилам.

Никакого отношения к тюркским корням или слову «дуня» (мир, вселенная) фамилия не имеет — это ложная этимология, которую иногда предлагают из-за внешнего сходства. В русском ономастиконе Дуняшев — чисто славянская фамилия, образованная от православного имени через народную форму.