Фамилия Дьякова (в старом написании — через «ять»: Дъякова) ведет начало от прозвища Дьяк. В основе — нарицательное «дьяк», которым в допетровской Руси называли не церковного служителя (это более позднее смешение), а чиновника: начальника или письмоводителя канцелярии приказа, думного дьяка или подьячего. Прозвище Дьяк относилось к «профессиональным» именованиям — указывало на род деятельности главы семьи.

Привычная форма Дьяков (с мягким знаком) закрепилась после реформы орфографии 1918 года, когда буква «ять» исчезла из алфавита. До этого написание Дъяков четко указывало на происхождение от слова «дъякъ» (через «ять»), а не от церковного «дьякон». В документах XVII–XVIII веков форма с «ятью» встречается в переписных книгах северных уездов и центральных вотчин — там, где приказные люди оседали семьями.

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: суффикс -ов присоединялся к прозвищу отца. Дьяковы — буквально «чьи?» — дети, внуки Дьяка. Это одна из самых распространенных моделей русских фамилий, но основа здесь не крестьянская, а служилая или приказная, что выделяет фамилию на фоне более массовых ремесленных прозвищ.

Встречаются и однокоренные варианты: Дьячков (от «дьячок» — низший церковнослужитель), Дьяконов. Смешивать их не стоит: Дьяков указывает именно на светскую должность. В некоторых говорах дьяками называли грамотных людей вообще, но первичное значение — канцелярский работник, часто из дворян или детей боярских, реже — из посадских.

Потомок человека с прозвищем Дьяк со временем получил фамилию Дьяков. Передаваясь из поколения в поколение, она сохранила память о происхождении предка — приказного человека, который вел делопроизводство в эпоху, когда грамотность была редким и ценным навыком.