Фамилия Дюбанькова — вариант женского рода от мужской формы Дюбаньков. В основе лежит прозвище или неканоническое имя Дюбан, Дюбань. Слово «дюба» в русских говорах имело несколько значений: так называли увальня, нерасторопного человека, а в некоторых областях — забияку или драчуна. Корень, вероятно, связан с глаголом «дюбать» — клевать, долбить, стучать. Прозвище Дюбан могли дать человеку с характерной манерой говорить отрывисто или же тому, кто работал с долотом, зубилом — плотнику, камнетёсу.

Модель образования типична для восточнославянских фамилий: к основе на -а/-я добавляется суффикс -к-, затем патронимический суффикс -ов. То есть Дюбаньков — буквально «сын Дюбаня». Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Дюба́нькова, хотя в бытовой речи возможны смещения.

Фамилия редкая. Географически она встречается в центральных и южных областях России, а также в Беларуси. Это не дворянская и не купеческая фамилия — её носителями были крестьяне и мещане. В дореволюционных переписях и метрических книгах Дюбаньковы фиксировались преимущественно в Смоленской и Могилёвской губерниях.

Стоит отличать Дюбанькова от похожих фамилий Дюбанов и Дюбин. Дюбанов образован от той же основы, но с другим суффиксом, а Дюбин чаще связывают с диалектным «дюба» — забияка. Дюбаньков же сохраняет уменьшительную или пренебрежительную форму исходного прозвища, что указывает на его более тесную семейную привязку: прозвище Дюбань давали кому-то одному в роду, и оно закрепилось за потомками.