Фамилия Дюдюкова — женская форма, мужской вариант — Дюдюков. В основе лежит прозвище или некалендарное имя Дюдюк. Словообразовательная модель проста: суффикс -ов- указывает на принадлежность («чей?» — Дюдюков), то есть «сын Дюдюка». Фамилия довольно редкая и не принадлежит к числу массовых русских фамилий, что сразу настораживает: её корни стоит искать не в частотных именах вроде Ивана или Петра, а в чём-то более локальном.

Самая вероятная версия связывает основу Дюдюк- с диалектным словом «дюдя» или «дюдюка». В ряде южнорусских и белорусских говоров так называли пугало, страшилище, нечто нелепое или пугающее. В смоленских и брянских говорах «дюдюка» — это ещё и баба-яга, кикимора, лесное пугало, которым детей стращают. Прозвище Дюдюк могли дать человеку с необычной внешностью, неопрятному, либо, наоборот, тому, кто любил пугать или разыгрывать. В ономастике такие «отпугивающие» прозвища — обычное дело: они не несли оскорбления в современном смысле, а скорее выполняли функцию оберега или просто метко описывали человека.

Вторая, менее распространённая версия, выводит фамилию из тюркских языков. В некоторых тюркских наречиях «дюдюк» (или «дюдюк») — это свирель, дудка. Если так, то прозвище мог получить музыкант-дудочник. Однако эта версия слабее: для тюркского заимствования фамилия слишком органично вписалась бы в русскую модель с суффиксом -ов, но фонетика «дюдю» скорее напоминает славянское звукоподражательное слово (ср. «дудка», «дудеть»). Поэтому версия с диалектным «пугалом» выглядит убедительнее.

Географически фамилия встречается преимущественно в западных и южных областях России — в Брянской, Смоленской, Калужской, а также на Украине и в Беларуси. Это подтверждает связь с местными говорами. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — в дворянских родословных книгах Дюдюковы не значатся. Фамилия не имеет отношения к церковным именам, что типично для прозвищных фамилий, возникших в крестьянской среде после отмены крепостного права, когда бывшие крепостные получили право закреплять фамилии по прозвищам.

Редкость фамилии делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если вы Дюдюкова, ваши предки с высокой вероятностью происходят из узкого региона, и найти их в документах проще, чем обладателей фамилий на -ов от распространённых имён.