Фамилия Джанакаева — редкий случай, когда географию происхождения можно определить почти безошибочно. Она ведет к народам Северного Кавказа, прежде всего к чеченцам и ингушам. Основа фамилии — мужское имя Джанака (Джанка, Джанах), которое в тюркских и кавказских языках восходит к персидскому «джан» — душа, жизнь. Имя Джанака — ласкательная форма, что-то вроде «душенька», «родной». Им называли долгожданного или любимого ребенка.

Суффикс -ев указывает на русскую модель оформления фамилий, принесенную на Кавказ в XIX — начале XX века. В исконной чеченской форме фамилия звучала бы как Джанаканан (чей? — Джанаки), но при записи в метрические книги и советские паспорта ее «обрусели», добавив стандартный суффикс принадлежности. Поэтому Джанакаева — это не исконно русская фамилия, а адаптированная к русской грамматике кавказская.

Женское окончание -а в начальной форме (Джанакаева, а не Джанакаев) — особенность, характерная для многих фамилий народов Кавказа. Там в официальных документах часто фиксировали форму женского рода, и она закреплялась за всей семьей. Так что, встретив фамилию Джанакаева, можно с высокой вероятностью предположить, что ее носитель или носительница имеют чеченские или ингушские корни, а предка звали Джанака.