Фамилия Ефремушкин — редкий случай, когда в одном слове уместились сразу две уменьшительные формы. В её основе лежит имя Ефрем, которое восходит к древнееврейскому Эфраим — «плодовитый». Но путь от библейского имени до современной фамилии не прямолинеен.

Сначала имя Ефрем превратилось в ласковую форму Ефремушка. Это типичный для русской народной традиции суффикс -ушк-, который придавал имени оттенок теплоты и близости (сравните: Иван — Иванушка, Михаил — Мишутка). А уже от этого уменьшительного имени с помощью патронимического суффикса -ин образовалась фамилия: Ефремушкин, то есть «сын Ефремушки». Двойная уменьшительность — редкая черта: большинство фамилий на -ин образованы от простых имён (Петров — от Пётр, Иванов — от Иван), а здесь — от уже смягчённой формы.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным регионам России, где суффикс -ушк- был особенно распространён в бытовой речи. Встречается она нечасто: по данным современных телефонных справочников, основная масса носителей живёт в Нижегородской, Кировской областях и в Чувашии. Это наводит на мысль, что предки Ефремушкиных могли быть выходцами из крестьянской среды: именно в деревнях ласкательные имена дольше держались в официальных документах, в то время как в городах их быстрее вытесняли полные формы.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна, но есть одна тонкость. Если бы она образовалась от полного имени Ефрем, мы бы получили Ефремов или Ефремин. Наличие «лишнего» слога —ушк- говорит о том, что в основе лежало не каноническое, а разговорно-бытовое имя. Это делает фамилию ценным свидетельством живого языка: она зафиксировала ту форму, которую имя Ефрем принимало в повседневном общении XVIII–XIX веков.