Фамилия Екимцовы (в мужском роде — Екимцов) образована от крестильного имени Иоаким, что с древнееврейского переводится как «прославленный богом». Однако в быту имя звучало иначе. На русской почве оно дало множество производных форм, и одна из них сложилась под влиянием «екающего» произношения — Еким. От него через уменьшительный суффикс -ец появилось прозвище Екимец, которое и легло в основу фамилии. Суффикс -ов в финале указывает на принадлежность: Екимцов буквально означает «сын Екимца».

Модель образования здесь классическая для русских фамилий, но с одной особенностью. Обычно патронимы на -ов/-ев образуются от полных или кратких форм имени (Иван — Иванов, Пётр — Петров), а в случае Екимцовых цепочка длиннее: имя → уменьшительное прозвище → фамилия. Такая двухступенчатая схема встречается реже и указывает, что предок был известен не просто как Еким, а именно как Екимец — возможно, младший в семье или человек небольшого роста.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и центральным областям, где «еканье» было нормой. В северных и сибирских говорах, где преобладало «оканье», ту же основу могли записать как Акимцов или Окимцов. Поэтому Екимцовы — яркий пример того, как региональная фонетика закреплялась в официальных документах. О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования фамилий шёл несколько столетий, и письменные источники могли фиксировать разные варианты даже в пределах одной семьи. Тем не менее, фамилия Екимцов сохранила живую народную речь той эпохи — произносительную норму, которая не всегда совпадала с книжной.