Фамилия Елисееноков — один из тех редких случаев, когда в основе лежит полное церковное имя, но сама фамилия образована нестандартным способом. В отличие от привычных Елисеевых или Елисеенко, здесь целых два суффикса: сначала уменьшительно-патронимический -ёнок (или -енок), а затем стандартный фамильный -ов. Это «фамилия от фамилии»: предка, скорее всего, звали Елисеёнок.

Исходное имя — Елисей (древнееврейское Элиша́, «Бог — спасение»). В крестьянской среде XIX века, особенно в западных и южных губерниях Российской империи, было принято называть младшего сына или внука по отцу с суффиксом -ёнок: Елисеёнок — буквально «маленький Елисей» или «сын Елисея». Позже, когда такие прозвания переходили в официальные фамилии, к ним добавляли -ов, чтобы «обрусеть» и вписаться в общую систему документов. Так появился Елисееноков.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где был распространён суффикс -ёнок: это Белоруссия, Смоленщина, Брянщина, а также южнорусские области. Встречается она редко — в современных телефонных справочниках и базах данных её носителей исчисляют единицами или десятками. Это говорит о том, что родословная, скорее всего, не разветвлялась широко или фамилия возникла поздно, уже в XIX — начале XX века, когда крестьянам массово присваивали фамилии.

Любопытная деталь: написание через «ё» (Елисеёноков) в дореволюционных метриках встречалось чаще, чем через «е». В советское время «ё» почти вытеснили, и фамилия закрепилась в форме Елисееноков, хотя произносить её по-прежнему можно с ударением на второй слог — Елисеёноков. Ударение на «о» (Елисеенóков) ошибочно, так как разрушает словообразовательную логику.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями: Елисеев — самая распространённая, от имени без суффикса; Елисеенко — украинский вариант; Елисеёнок — исходная форма без -ов. Елисееноков стоит особняком — он показывает, как фамилия «достраивалась» до более привычного стандарта, сохранив при этом память о том, что предка в деревне звали не полным именем, а ласково и по-свойски: Елисеёнок.