Фамилия Елисенко — типичный пример восточнославянской фамилии на -енко, которая в украинской ономастике играет ту же роль, что русские фамилии на -ов/-ев. Суффикс -енко в буквальном смысле означает «маленький», «сын» или «потомок», поэтому Елисенко — это «сын Елисея» или «потомок Елисея». Основа фамилии — разговорная форма Елисей от полного канонического имени Елисей.

Само имя Елисей пришло на Русь из древнееврейского (Элиша), что переводится как «Бог — спасение» или «Бог спасает». В православных святцах это имя носил библейский пророк, ученик Ильи. В народной среде имя быстро обросло уменьшительными вариантами: Елис, Елися, Елисеня. От последнего и пошла фамилия Елисенко — через форму Елисеня + суффикс -енко, где -ен- — это наращение, характерное для украинской модели образования от имён на -я.

Географически фамилия Елисенко тяготеет к юго-западным регионам: современная Украина, особенно Черниговская, Полтавская и Сумская области, а также юг России (Кубань, Ростовская область), куда украинские крестьяне переселялись в XVIII–XIX веках. Встречаемость фамилии невысокая, что говорит о её локальном происхождении: скорее всего, родоначальник жил в одном селе или хуторе, и фамилия не успела широко разойтись.

С точки зрения социального контекста, фамилии на -енко в основном носили крестьяне и казаки. В реестрах Запорожского войска таких фамилий множество. Елисенко мог быть потомком казака, получившего прозвище по отцу, либо крестьянина, чьё имя записали в метрику как «Елисенко» (то есть «сын Елисея»). Дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано — она осталась в простонародной среде.

Интересная деталь: в некоторых говорах имя Елисей произносили как Олисей, откуда пошли фамилии Олисенко, Олисов. Но Елисенко сохранило начальное «Е», что указывает на более книжное, церковное произношение имени. Это редкий случай, когда разговорная форма не «проглотила» первый гласный, а осталась близкой к оригиналу.

Таким образом, если ваша фамилия Елисенко, то, скорее всего, ваш предок жил на территории современной Украины или юга России, был крестьянином или казаком, а его отца звали Елисей. Фамилия прямая, без дополнительных прозвищных наслоений — просто «сын Елисея».