Основой фамилии Елпатов послужило церковное имя Евпатий. Имя Евпатий в переводе с греческого языка означает «чувствительный». В основе фамилии Елпатов лежит производная форма этого имени — Елпат. Имя Евпатий носил богатырь по прозвищу Коловрат, герой древнерусских сказаний XIII века, рязанский вельможа и воевода. С отрядом в 1700 человек, уцелевших от татаро-монгольского разгрома Рязани, он напал на стан хана Батыя и привел захватчиков в замешательство, перебив многих монгольских богатырей. По другой версии, в основе данной фамилии лежит производный вариант греческого имени Ипатий — Ипат. Это имя на русский язык переводится как «высочайший». Имя Ипатий носил знаменитый православный проповедник и сторонник унии (идеи соединения западной и восточной церквей) Ипатий Поцей. Чередование Е/И объясняется влиянием екающих говоров. Скорее всего, основатель рода Евпатовых был выходцем из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Елпат, со временем получил фамилию Елпатов.