Фамилия Емелюкова — женская форма фамилии Емелюков, и её происхождение стоит искать не в географическом названии или прозвище от ремесла, а в личном имени. Основа фамилии — уменьшительная форма Емеля от канонического крестильного имени Емельян (в церковной форме Емилиан). Имя Емилиан восходит к римскому родовому имени Aemilius, что значит «соперник» или «ревностный». В русском языке имя дало множество народных вариантов: Емельян, Емеля, Емелька, Емелюк. Последняя форма — Емелюк — редкая, с характерным для южных и западнорусских говоров суффиксом -юк (сравните: Иван — Иванюк, Петр — Петрюк). Он указывал на принадлежность или сыновство: Емелюк — сын Емели.

Фамилия Емелюков, а следовательно и Емелюкова, образована по стандартной модели: к основе Емелюк прибавлен патронимический суффикс -ов, означающий «чей?» — то есть потомок Емелюка. Важная деталь: в отличие от распространённых Емельяновых или Емелиных, фамилия Емелюков встречается значительно реже. Согласно данным региональных архивов и телефонных справочников, основная зона её бытования — юг России, особенно Краснодарский край и Ростовская область, а также Белгородчина. Это объяснимо: суффикс -юк типичен для украинской и южнорусской антропонимии, и фамилия могла закрепиться в среде переселенцев с Украины или в казачьих родах.

Если говорить о социальном контексте, то носители фамилии Емелюковы, скорее всего, относились к крестьянскому или казачьему сословию. Прозвище Емеля в народе нередко ассоциировалось с простаком или ленивцем (вспомните сказку «По щучьему веленью»), но это не обязательно отражало реальный характер предка: уменьшительные имена часто давались без какого-либо негативного оттенка, просто как ласкательный вариант. Таким образом, фамилия Емелюкова — типичная патронимическая фамилия, образованная от редкой народной формы имени Емельян, и её редкость делает её своеобразным маркером конкретного регионального корня.