Фамилия Епин — это классический образец русской фамилии, которая родилась из крестильного имени. В её основе лежит каноническое имя Епифан, которое пришло на Русь вместе с христианством из Византии. Греческое слово «epifanes» переводится как «видный», «знатный» или «известный» — родители, называя так сына, желали ему почёта и высокого положения.

В повседневной речи полное имя Епифан было громоздким, и его сократили до ласковой формы Епя. Такое стяжение — обычное дело для русской ономастики: так же появились фамилии Епифанов (от полной формы) и Епишин (от другой производной). Именно от этого просторечного варианта — Епя — и пошла фамилия Епин, где суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Епин», то есть сын или потомок человека по имени Епя.

Имя Епифан на Руси было нередким, и в народе даже сложили поговорку про бедняка: «Рад Епифан, что нажил серый кафтан». Она подчёркивает, что носители этого имени были из простых слоёв, а не из знати. Святых покровителей у имени несколько: преподобномученик Епифаний, святитель Епифаний Кипрский, патриарх Константинопольский и мученик Епифаний Мелитинский.

Точную дату появления фамилии Епин назвать трудно: фамилии у крестьян и горожан закреплялись на протяжении нескольких веков, с XV по XIX. Однако ясно, что её корень — чисто русский, образованный по живой модели народной речи.