Фамилия Епинин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Епинин послужило церковное имя Епифан. Имя Епиня является производной формой канонического мужского имени Епифан (от греческого «epifanes» - «видный, известный, знатный»). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Епиня, со временем получил фамилию Епинин. О точном месте и времени возникновения фамилии Епинин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Епинин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.