Мужское крестильное имя Иеремия в переводе с древнееврейского языка означает «возвышенный Богом». В основу фамилии легла производная форма этого имени — Ерема. Скорее всего, фамилия Еремакин изначально возникла на территории Украины или Белоруссии, о чем свидетельствует характерный суффикс -ак. Со временем, вероятно, род Еремак переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ин. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ерема, со временем получил фамилию Еремакин.