Фамилия Еркибаева — женская форма, образованная от фамилии Еркибаев, а та, в свою очередь, от казахского составного имени Еркибай. Основа имени — два корня: «ерке» (любимец, баловень) и «бай» (богатый, господин). Такие двухосновные имена — распространённая тюркская традиция, где вторая часть («бай») указывала на пожелание богатства и высокого положения.

Скорее всего, имя Еркибай давали долгожданному ребёнку, которого в семье баловали. Родители вкладывали в имя надежду, что сын вырастёт не только любимым, но и состоятельным, уважаемым человеком. Со временем от имени Еркибай образовалась фамилия Еркибаев, а от неё — женский вариант Еркибаева.

По словообразовательной модели фамилия близка к другим казахским фамилиям на -баев/-баева (Куандыкбаев, Бекбаев). Суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих) указывает на принадлежность: «сын Еркибая», «из рода Еркибая». Такие фамилии массово закреплялись у казахов в XIX–XX веках, когда в обиход вошли русские патронимические окончания.

Географически фамилия Еркибаева встречается в Казахстане и среди казахской диаспоры. В русском контексте она сохранила исходное ударение, которое падает на последний слог: Еркиба́ева.