Фамилия Еркина (и её вариант Ёркин) — это отчество, образованное от уменьшительной формы крестильного имени. В основе лежит имя Ерка, которое служило бытовым сокращением сразу для нескольких христианских имён: Еремей («возвышенный Богом» с древнееврейского), Ермолай («вестник народу»), Ермий («дающий богатство»), Ерофей («освящённый Богом») и Иероним («священноимённый»). Такая многозначность типична для народных форм: имя укорачивали до одного-двух слогов, не задумываясь о точном церковном источнике. Вероятно, основатель рода Еркиных был выходцем из крестьянской или рабочей среды — именно в этих сословиях уменьшительные имена чаще всего становились основой фамилий.

Сложнее обстоит дело с фамилией Ёркин, которую нередко путают с Еркиным из-за совпадения на письме (букву «ё» часто заменяют на «е»). Если фамилия произносится с ударением на первый слог, её корень, скорее всего, не церковный, а прозвищный. Прозвище Ёрка могло возникнуть от диалектного глагола «ёркнуть» — «ударить, хлестнуть, стегнуть». В таком случае Ёркой называли пастуха или погонщика скота, то есть прозвище указывало на профессию. Другая версия связывает Ёрку с глаголом «ёрить» — «суетиться, упрямиться»; тогда прозвище отражало характер: хлопотливый, деловой или своенравный человек. Не исключено, впрочем, что и Ёрка — та же народная форма от имён Еремий, Ермил или Ерофей, но с другим произношением. Как бы то ни было, потомок человека по прозвищу Ёрка со временем получал фамилию Ёркина.

Из известных носителей варианта с «ё» — советский хоккеист, мастер спорта Евгений Михайлович Ёркин.