Фамилия Еркины (а также её мужские формы — Еркин и Ёркин) — двойная по происхождению. В одном случае она образована от имени, в другом — от прозвища, и путать эти линии не стоит, хотя на письме они почти слились.

Первая версия ведёт к крестильному имени Ерка. Это не самостоятельное имя, а уменьшительная форма от целого ряда христианских имён: Еремей (древнееврейское «возвышенный Богом»), Ермолай (греческое «вестник народу»), Ермий (греческое «дающий богатство»), Ерофей (греческое «освящённый Богом»), Иероним (греческое «священноимённый»). В быту такие сокращения были обычны: длинные и непривычные для русского слуха календарные имена стягивали до двух-трёх слогов. Потомок человека по имени Ерка получал фамилию Еркин — то есть «чей?» — «Еркин сын». По этой модели в России образованы тысячи фамилий (Петров, Иванов, Сидоров — все от имён).

Вторая версия — прозвищная, и она относится к фамилии Ёркин. Основа здесь — диалектный глагол «еркнуть», то есть «ударить, хлестнуть, стегнуть». Прозвище Ёрка могли дать человеку вспыльчивому, резкому в движениях или в словах. Есть и другая возможность: Ёркой называли погонщика скота или пастуха — здесь прозвище переходило в профессиональное именование. В таком случае фамилия Ёркин — не от имени, а от занятия или характера.

Разница между Еркин и Ёркин не всегда заметна в документах: букву «ё» в XIX–XX веках часто заменяли на «е» из-за необязательности её написания. Поэтому в современных записях обе линии могут выглядеть одинаково — Еркин. И только если известно, как произносили фамилию в семье (с твёрдым «е» или с «ё»), можно точнее определить её корни.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: это одна из старейших русских фамильных моделей, характерная для имён и прозвищ на -а/-я. Фамилия Еркины — множественная форма, типичная для обозначения целого рода или семьи.

Точное место и время возникновения фамилии Еркин (или Ёркин) установить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, и такие «простые» по форме фамилии могли появиться в разных регионах независимо друг от друга.