Фамилия Ермишенков — один из примеров того, как славянская фамилия меняла свой облик при перемещении семьи из одной земли в другую. В основе лежит церковное имя Ермил (полная форма — Ермилий). С греческого оно переводится как «из гермесовой рощи» — Гермес в античной мифологии считался покровителем дорог и торговли, а его храмы нередко стояли в священных рощах. Покровитель имени — мученик Ермил, память которого приходится на 26 января.

От полного имени образовали уменьшительную форму — Ермиша. Это естественное для бытового общения сокращение, как, скажем, Тимоша от Тимофей или Дёма от Дементий. Именно от Ермиши и пошла фамилия. Но ключевая особенность — её суффиксальная история. Первоначально фамилия звучала как Ермишенко: суффикс -енко характерен для украинской и белорусской ономастики, он указывал на потомка («чей?» — Ермишин сын). Такие фамилии массово фиксировались в Поднепровье и на Левобережной Украине в XVI–XVII веках.

Позже, когда носители фамилии оказались в великорусских землях, произошла русификация. К основе Ермишенко добавили типичный русский патронимический суффикс -ов. Так Ермишенко превратилось в Ермишенков — форму, которая звучит уже по-великорусски, но хранит память о южном происхождении. Подобная «двойная» модель встречается нечасто: она показывает, что предки меняли регион проживания и адаптировали фамилию под местные традиции.

О точном месте и времени возникновения фамилии Ермишенков говорить сложно: процесс формирования фамилий был долгим и неоднородным. Однако по языковым приметам ясно: корни рода — в западнорусских или украинских землях, а окончательный облик фамилия приобрела уже на территории России.