Фамилия Ермышина — женская форма фамилии Ермышин, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Ермыш. Основа здесь — редкое для современных русских фамилий имя Ерма или Ермил, но с характерным суффиксом -ыш. В русской ономастике суффикс -ыш часто указывает на уменьшительно-ласкательную или пренебрежительную форму имени, а также может обозначать человека по характерному признаку (например, Малыш, Глупыш). В случае с Ермышем, скорее всего, это производное от имени Ермолай (народная форма Ерма) или от Ермил (церковное Ермил). Суффикс -ыш добавлял оттенок «маленький Ерма» или «сын Ермы», что в XVI–XVII веках было обычной практикой для образования неофициальных семейных прозвищ.

Модель образования фамилии стандартна для русского севера и центральной России: основа на согласный (Ермыш) плюс суффикс принадлежности -ин. Если бы основа оканчивалась на -а или -я, появился бы суффикс -ов/-ев. Фамилия Ермышин (и её женская форма Ермышина) фиксируется в основном в документах по Вологодской и Архангельской областям, а также в Поволжье — это косвенно указывает на возможное происхождение из новгородских или поморских земель, где имя Ермолай было особенно популярно.

Спорных версий немного. Некоторые исследователи допускают связь с диалектным словом «ермыш» — так в ряде говоров могли называть нелюдимого или ворчливого человека. Однако это объяснение менее вероятно: суффикс -ыш в прозвищах чаще прикреплялся к личным именам, а не к нарицательным словам. К тому же в словарях русских говоров слово «ермыш» не зафиксировано как устойчивое, тогда как имя Ерма встречается повсеместно.

Таким образом, носительница фамилии Ермышина может считать своим предком человека по имени Ермыш — скорее всего, крестьянина или посадского человека, которого в быту звали уменьшительно от Ермолая или Ермила. Фамилия не дворянская и не купеческая: суффикс -ин в сочетании с редкой основой типичен для крестьянской среды, где фамилии закреплялись позже, в XVIII–XIX веках, и часто отражали уличное прозвище отца.