Фамилия Евсигнеева образована от крестильного имени Евстигней. В переводе с греческого оно означает «добрый знак», и в народной речи имя упростили до формы Евсигней — именно она и легла в основу фамилии. Покровителем этого имени считается мученик Евстигней, который много лет прослужил в армии, а в старости, оставив военное дело, посвятил себя молитвам и посту. По преданию, его казнили в возрасте 110 лет за веру.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Евсигнеева — это «дочь (или жена) Евсигнея». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на мягкий согласный. Вероятнее всего, основатель рода Евсигнеевых был выходцем из крестьянской или рабочей среды: в этих сословиях фамилии на -ев и -ов закреплялись за целыми семьями по имени главы дома.

Существует и вторая версия происхождения, менее вероятная, но допустимая. Некоторые исследователи связывают форму Евсигней с именем Евсевий (в переводе с греческого — «благочестивый») и его краткой формой Евсей. В таком случае фамилия могла возникнуть как вариантное производное от того же корня, но через другое каноническое имя. Однако прямое происхождение от Евстигнея считается основным, поскольку фонетический переход «сти» в «си» (Евстигней → Евсигней) типичен для русской народной речи — так имя адаптировалось к привычному звучанию.

Фамилия Евсигнеева — не самая распространённая, но устойчиво встречается в центральных и южных областях России. Её женская форма не меняется по родам: она принадлежит и женщине, и всей семье в целом.