Фамилия Фандеев образована от арабо-персидского мужского имени Фандей, которое переводится как «преданный всем сердцем науке; отдающий всю душу науке». Вероятно, родители, нарекая ребёнка таким именем, желали своему сыну прилежным учеником или даже ученым, мудрецом. Менее вероятно, что фамилия Фандеев восходит к украинскому слову «фанда» — «длинный кнут». В таком случае, Фандеем могли прозвать пастуха, худого человека или мастера по изготовлению кнутов.