Фамилия Фандеева образована от арабо-персидского мужского имени Фандей, которое переводится как «преданный всем сердцем науке; отдающий всю душу науке». Вероятно, родители, нарекая ребёнка таким именем, желали своему сыну прилежным учеником. Менее вероятно, что фамилия Фандеева восходит к украинскому слову «фанда» — «длинный кнут». В таком случае, Фандеем могли прозвать пастуха, худого человека или мастера по изготовлению кнутов. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Фандеевых можно лишь на основании генеалогических исследований.