Фамилия Фандеев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Фандеев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Фандеев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Фандеев образована от арабо-персидского мужского имени Фандей, которое переводится как «преданный всем сердцем науке; отдающий всю душу науке». Вероятно, родители, нарекая ребёнка таким именем, желали своему сыну прилежным учеником или даже ученым, мудрецом. Менее вероятно, что фамилия Фандеев восходит к украинскому слову «фанда» — «длинный кнут». В таком случае, Фандеем могли прозвать пастуха, худого человека или мастера по изготовлению кнутов. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Фандеев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Фандеев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.