Фамилия Фарапонов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Фарапонов ведет свое начало от имени Фарапон (Фарапонт), которое является производной формой крестильного мужского имени Ферапонт, которое в переводе с древнегреческого означает «спутник, помощник; гостеприимный, услужливый», а также «ученик». Скорее всего, основатель рода Фарапоновых получил от своих родителей это имя в честь святого покровителя - священномученика Ферапонта, епископа Сардинского, который за обращение язычников ко Христу был подвергнут мучениям и был обезглавлен (III в.). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Фарапон, со временем получил фамилию Фарапонов. О точном месте и времени возникновения фамилии Фарапонов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Фарапонов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.