Фамилия Фарси — редкий случай, когда русская по форме фамилия почти наверняка имеет иноязычную основу. Если отбросить суффикс -и (который в русских фамилиях встречается нечасто и обычно указывает на украинское или белорусское происхождение, как в фамилиях Гузий, Палий), то корень «Фарс» сразу выводит за пределы славянского мира. Самое прямое объяснение: фамилия образована от этнонима «фарси» — самоназвания персов в Иране (язык фарси). В этом случае предок носителя фамилии мог быть персом по происхождению или человеком, получившим прозвище «Фарси» за внешность, говор или связь с Востоком.

Однако есть и другая версия, менее экзотичная, но более вероятная для русской среды. В южных и западных губерниях Российской империи фамилию могли дать от прозвища, связанного со словом «фарс» — в значении «шутка, комедия, кривляние». В украинском и белорусском языках «фарса» или «фарс» могло означать насмешливого, острого на язык человека, балагура. Тогда Фарси — это «сын Фарса», то есть потомок того, кого дразнили шутом. Суффикс -и в таком случае — типичный западнорусский или украинский фамильный показатель, аналогичный русскому -ов.

Географически фамилия Фарси крайне редка. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках она почти не встречается, что говорит о её позднем закреплении или малом числе носителей. В современной России она рассеяна точечно, без выраженного регионального гнезда. Встречается также вариант Фарсов — с русским суффиксом -ов, что подтверждает: основа «Фарс» воспринималась как прозвище, а не как этноним.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Фарсов, Фарсин, Фарсиев) показывает, что все они образованы от одного корня, но разными способами. Фарси — наиболее архаичная форма, сохранившая прямой падеж прозвища без дополнительного суффикса принадлежности. Это характерно для фамилий, сложившихся в среде, где прозвище просто перешло на потомков без переоформления — так бывало у казаков или в мелкопоместной шляхте.

Таким образом, носитель фамилии Фарси может с равной вероятностью оказаться потомком выходца из Персии или потомком местного острослова. Без генеалогического исследования определить точно нельзя, но лингвистически вторая версия для русской почвы выглядит естественнее.