Фамилия Фефелина — женская форма, а её мужской вариант — Фефелин. В основе лежит редкое для современного слуха имя или прозвище Фефел, Фефела. Точное происхождение этого корня вызывает споры, но самая убедительная версия связывает его с греческим именем Феофил (Theophilos — «любящий Бога»). В народной речи имя Феофил могло упроститься до Фефил, а затем перейти в Фефел — через замену звуков или под влиянием местных говоров. Такая трансформация — не редкость: Феофан превращался в Фофан, а Феодор в Фёдор.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «фефела» — так в некоторых русских говорах называли нерасторопного, простоватого человека. Однако в этом случае фамилия носила бы прозвищный характер, а не образовалась от крестильного имени. В пользу церковной версии говорит суффикс -ин: фамилии на -ин в русской традиции чаще всего образовывались от имён или прозвищ на -а, -я. Если основа Фефел — это производное от Феофил, то фамилия означает «потомок Фефела», то есть человека, носившего это имя в бытовом, упрощённом варианте.

География фамилии Фефелин/Фефелина тяготеет к центральным и северным регионам России. Встречается в Вологодской, Костромской, Нижегородской областях — там, где старообрядческие традиции дольше сохраняли архаичные формы имён. В отличие от фамилий вроде Феофилов или Фефилов, которые остались ближе к книжному варианту, Фефелин прошёл через живую народную переделку — это указывает на глубокую укоренённость в крестьянской среде, а не в дворянской или духовной.

Интересно, что однокоренные фамилии — Фефелов, Фефилов, Феофилатов — все восходят к одному источнику, но разошлись в написании из-за местных произносительных норм. Фефелин — один из самых редких вариантов, его носители, скорее всего, потомки одного локального рода, где имя Фефел закрепилось как родовое прозвище.