Фамилия Фений образована от уменьшительной формы одного из крестильных мужских имен, содержащих слог «фе», звучавшей как Фений. Так, это могло быть мужское имя: Феона (от греческого «божественное разумение»), Парфений (от греческого «девственный, чистый»), Фемистокл (от греческого «прославленный за справедливость») или Фемелий (от греческого «основание, краеугольный камень»). Не исключено также, что имя Фений восходит к одному из женских имен: Федосья, Федотья (оба имени – от греч. Следует отметить, что фамилии, образованные от женских имен, малочисленны, поскольку традиционно за основу бралось имя отца как родоначальника и главы семейства.