Имя Филалей, которое легло в основу фамилии Филалеев, представляет собой уменьшительный вариант от канонического мужского имени Фалалей, которое, предположительно, восходит к греческим словам thallō — «цвести» и elaia — «маслина» и переводится на русский как «цветущая маслина». Не исключено, что именование Филалей было прозвищем, которое указывало на особенности характера предка. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет слово «фалалей» как «простак, разиня». Соответственно, Филалеем могли прозвать бесхитростного, медлительного человека.