Фамилия Филареев — это типичный пример русской «семейной» фамилии, образованной от полного церковного имени. Её основа — каноническое имя Филарет, которое в переводе с греческого (philaretos) означает «любящий добродетель» или «любитель добродетели». Имя это в святцах встречается, но в народном быту было не таким частым, как, скажем, Иван или Михаил, поэтому и фамилия Филареев встречается реже однокоренных «популярных» вариантов.

Модель образования проста: к имени Филарет добавили типичный русский суффикс принадлежности -ев (вариант -ов после мягкого согласного). Так Филареев — буквально «сын Филарета» или «человек из рода Филарета». Интересно, что в XIX веке встречалось и написание через «ять» — Филареевъ, но это лишь графическая особенность дореформенной орфографии, не менявшая смысла.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным губерниям России, где церковные имена приживались активнее, а также к среде духовенства. Священники и монахи нередко брали себе «говорящие» фамилии по имени святого или по добродетели, и Филарет в этом ряду — вполне логичный выбор для человека, принявшего постриг или служившего при храме. Однако не стоит думать, что все Филареевы — потомки духовенства. В крестьянской среде тоже могли назвать сына Филаретом в честь деда или местночтимого святого, и фамилия закреплялась за целой семьёй.

С точки зрения словообразования примечателен суффикс -ев, а не -ов. В русских фамилиях -ев обычно присоединяется к основам на мягкий согласный или на -й. Имя Филарет заканчивается на твёрдый «т», но по правилам церковнославянской и старой русской традиции оно могло восприниматься как основа на мягкий согласный (Филарет → Филарета → Филареев). Это не ошибка, а архаичная норма: фамилии на -ев от имён на твёрдый согласный (например, Андреев, Матвеев) как раз показатель старинного ударения или книжного происхождения.

Итог прост: Филареев — фамилия, которая прямо говорит о предке по мужской линии, носившем имя Филарет. По сословному составу её носители могли быть как из духовного звания, так и из крестьян или мещан, но в любом случае корень фамилии — не прозвище, а полное христианское имя с явным нравственным подтекстом.