Фамилия Филатьев происходит от имени Филатий — упрощённой формы редкого крестильного имени Феофилакт, которое в переводе с греческого означает «хранимый Богом». Полное имя оказалось тяжёлым для русского произношения, и в обиходе оно сокращалось, давая начало самостоятельным формам вроде Филат, Филатий и Филатьев. Суффикс -ев указывает на типичную для русских фамилий модель притяжательности: Филатьев буквально означает «сын Филатия».

На Руси выбор имени не был случайным. Считалось, что ребёнок, названный в честь святого или великомученика, получает незримую защиту и его судьба складывается светлее. Поэтому имя Феофилакт, несмотря на сложность, пользовалось уважением, а его краткая форма Филатий закрепилась в обиходе. Потомки человека с таким именем со временем стали носить фамилию Филатьев, и она передавалась из поколения в поколение уже как родовое прозвание.

Интересно, что фамилия Филатьев не единственная, рождённая от этого корня. К той же основе восходят Филатов и Филатьевский, но именно форма с -ев встречается реже и чаще связана с северорусскими и поморскими территориями, где любили сокращать церковные имена до кратких бытовых вариантов. В документах XVI–XVII веков встречаются посадские люди и крестьяне с такой фамилией, что говорит о её распространении не только среди духовенства, но и в среде простых горожан.

Словообразовательная цепочка здесь прозрачна: Феофилакт → Филатий → Филатьев. Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Филатов получил более широкое хождение, а Филатьев сохранил оттенок архаичности и региональной окраски. В современных справочниках фамилию нередко ошибочно связывают с греческим словом «филатия» — любовь к Богу, но это народная этимология: на деле основа чисто крестильная, а не нарицательная.