Фамилия Филонская — редкий случай, когда географическая привязка спорит с суффиксальной моделью. Обычно фамилии на -ский/-цкий указывают на дворянское происхождение или на связь с местностью: владелец поместья Филоны, выходец из села Филоново или Филонки. Но в случае Филонской всё сложнее.

Основа фамилии — имя Филон. Это не исконно славянское имя, а греческое Φίλων (Philon), что значит «любящий», «друг». В православных святцах есть несколько святых с таким именем, например мученик Филон, пострадавший за веру в III веке. В русской традиции имя Филон встречалось, но было редким, чаще в монашеской среде или у южных славян. От него пошли фамилии Филонов, Филоненко, Филоновский. Филонская — форма женского рода, но как наследственная фамилия она закрепилась в мужском варианте Филонский.

Суффикс -ск- в фамилии Филонский может указывать на два пути. Первый — прозвище или имя отца легло в основу фамилии по модели «чей?»: Филон → Филонский (сын Филона). Такая модель встречалась у духовенства, где фамилии часто образовывали от имён святых или от латинизированных форм. Второй путь — топонимический. В Польше, Беларуси и на Украине есть несколько населённых пунктов с корнем Филон-: например, село Филоновка на Черниговщине или деревня Филоны в Гродненской области. Выходец из такого места получал прозвище Филонский, а его жена или дочь — Филонская.

Написание через «о» в первом слоге (Филонская) — вариант, закрепившийся в русской орфографии. В украинской и польской традициях возможны варианты Філонська, Filonska. Ударение, судя по аналогичным фамилиям, падает на второй слог: Фило́нская.

Что касается сословия: носители фамилии Филонский встречались и среди дворян (например, в списках польской шляхты), и среди крестьян. Фамилии на -ский не всегда означали аристократию — на востоке Украины и юге России так могли называть любого, кто пришёл из села с таким названием. Точной статистики по Филонской нет, но фамилия остаётся редкой: в современных базах данных её носители фиксируются в основном в центральной России и на юге Беларуси.

Таким образом, Филонская — фамилия с двойной историей: либо от личного имени Филон через суффикс принадлежности, либо от названия места, где жил предок. Оба варианта правдоподобны, но топонимический — чуть вероятнее из-за распространённости модели -ский у выходцев из сёл.