Основой фамилии Флегентов послужило церковное имя Флегонт. Фамилия Флегентов образована от имени Флегонт, которое в переводе с латинского означает «горящий, ревностный». В православный именник оно вошло благодаря апостолу Флегонту, день памяти которого отмечается 17 января и 21 апреля. Святым покровителем этого имени является апостол Флегонт. Он упоминается в послании апостола Павла к римлянам: «Приветствуйте Асинкрита, Флегонта, Ерма, Патрова, Ермия и других с ними братьев». Это свидетельствует о высоком положении Флегонта в римской церкви, раз он удостоился приветствия от апостола Павла. Церковное предание сообщает, что он был обращен в христианство апостолом Павлом и был поставлен епископом Марафона Фригийского где и принял мученическую смерть. Эти же сведения содержатся в церковной службе, посвящённой Флегонту: «Марафонстии жители предстателя тя величайша и учителя изрядна, и светильника, и наставника имуще, Флегонте славне, почитают тя непрестанно». Существует мнение, что Флегонт был вольноотпущенником императора Нерона. В православной церкви память Флегонта совершается 21 апреля и 17 января в день Собора Апостолов. Чередование гласных о/е в фамилии объясняется историческими изменениями в языке. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Флегент, со временем получил фамилию Флегентов.