Фамилия Флегонтовы — редкий и яркий пример русской фамилии, образованной от полной формы крестильного имени. В отличие от более распространённых фамилий, возникших из уменьшительных или обиходных форм (вроде Флегонтов от Флегон), здесь мы видим прямую основу. Это указывает на то, что предок, носивший имя Флегонт, был человеком уважаемым или занимал заметное положение в своей общине: на Руси фамилии от полной формы имени чаще получали люди грамотные или духовного звания, тогда как крестьяне и ремесленники обычно «закреплялись» в документах через уменьшительные имена.

Само имя Флегонт — греческого происхождения. Оно восходит к слову «флегон», что значит «горящий, ревностный». Это редкое имя попало в русский именослов через церковный календарь. Покровителем имени считается апостол от семидесяти Флегонт. Церковное предание сообщает, что его обратил в христианство сам апостол Павел, после чего Флегонт был поставлен епископом Марафона Фригийского, где и принял мученическую смерть за веру. Память этого святого православная церковь совершает 17 января и 21 апреля — эти даты могли быть именинами для многих носителей имени.

Суффикс -ов в фамилии указывает на типичную притяжательную модель: Флегонтов буквально означает «сын Флегонта» или «человек из рода Флегонта». Такая модель была самой распространённой в центральной России и на Севере, окончательно закрепившись к XVII–XVIII векам. Однако у фамилии есть и редкая особенность: имя Флегонт само по себе было нечастым. Поэтому Флегонтовы — это, как правило, потомки одного или нескольких немногочисленных родов, а не огромного «гнезда» однофамильцев, разошедшегося по всей стране.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, а редкие имена могли «оседать» в разных губерниях независимо друг от друга. Тем не менее, фамилия Флегонтов — это не просто память о конкретном человеке, а замечательный памятник славянской письменности и культуры, сохранивший для нас почти забытое сегодня, но звучное и исполненное внутренней энергии греческое имя.