Фамилия Фондос — редкий случай, когда основу можно почти наверняка связать не с русским, а с греческим языком. В русском языке нет корня «фонд-» в значении прозвища или имени, зато в греческом «φόντος» (фондос) означает «дно» или «глубина». Скорее всего, прозвище Фондо́с дали человеку, который жил в низине, у подножия горы, или же тому, кто отличался «глубоким», основательным характером. Слово могло попасть в фамилию через греков Причерноморья или через выходцев из балканских регионов.

Модель образования здесь нестандартная. Фамилия не имеет привычного русского суффикса (-ов, -ин, -ский) — она застыла в форме чистого прозвища или имени. Это типично для фамилий, которые принесли переселенцы: греки, болгары, молдаване. На русской почве окончание -ос могли осмыслить как «греческое», что и закрепило написание. Если бы фамилия русифицировалась, мы бы получили Фондов или Фондин, но этого не произошло.

Версия о связи с греческим словом «фондос» (дно) — основная. Альтернативные гипотезы выглядят натянуто. Связывать фамилию с французским «fond» (основа) или русским «фонд» (запас) лингвистически неоправданно: в русской среде такие слова не превращались в прозвища, а в качестве фамилий они появились бы поздно, из семинарской среды, но без суффикса — крайне редко.

Географически фамилия Фондос встречается на юге России, в Краснодарском крае, Ростовской области, а также в Крыму. Это подтверждает греческую или понтийскую основу: именно в этих регионах оседали греческие переселенцы в XIX–XX веках. Сословно носители фамилии могли быть мещанами или крестьянами, но точных данных о принадлежности к дворянству нет — фамилия не фигурирует в родословных книгах.

Известных носителей с этой фамилией в публичном поле мало, что делает её поиск для генеалога непростой задачей. Однако сама фамилия — живой маркер миграции и культурного обмена: она сохранила греческое слово в почти неизменном виде, минуя русскую грамматику.