Фамилия Фундорка — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище, связанное с диалектным словом. Сразу бросается в глаза необычный суффикс -ка. В русских фамилиях он редко встречается в чистом виде — обычно это украинский или белорусский след, где -ка могло быть уменьшительной формой, но также и указанием на происхождение: «сын такого-то». Однако в случае с Фундорка, скорее всего, перед нами застывшая форма прозвища, а не патроним.

Корень «фундор» явно не славянского происхождения. Самая правдоподобная версия ведет к немецкому или идишу. В немецком «Funder» — это либо фамилия, образованная от глагола «finden» (находить), либо профессиональное прозвище «искателя», «сыщика» или даже «находчика» (человека, который нашел клад или беглого). В южнорусских и западных губерниях, где было много немецких колонистов, такие прозвища легко приживались. Вторая версия — от идишского «фундер» (основатель, учредитель). В таком случае прозвище могли дать предприимчивому человеку, который что-то основывал: деревню, мастерскую или торговое дело.

Версия о связи с польским «funda» (шнурок, завязка) или чешским «fundovat» (основывать, жертвовать) менее вероятна, но полностью исключать её нельзя. В любом случае, фамилия не крестьянская в классическом смысле — она несет отпечаток межкультурного контакта, скорее всего, на западе или юге Российской империи, в регионах со смешанным населением.

Суффикс -ка в данном случае мог выполнять функцию русификации или адаптации: немецкое прозвище Funder обрастало русским окончанием, чтобы вписаться в местную систему именования. Встретить такую фамилию можно в единичных случаях, в основном у потомков мещан или однодворцев. Поскольку фамилия штучная, её носители, скорее всего, восходят к одному роду, который когда-то получил это прозвище за особую сметку или деловую хватку.