Фамилия Фундовная — редкий случай, когда женская форма закрепилась в качестве основной. В русской традиции фамилии на -ая, -яя обычно принадлежали женщинам, но в некоторых регионах, особенно на юге России и Украине, такие формы становились фамилиями целых родов независимо от пола носителя. Сейчас, по правилам русской грамматики, Фундовная склоняется как прилагательное, и мужской вариант — Фундовный.

Основа фамилии — слово «фунд» или «фунда». В украинском и южнорусских говорах «фунд» означал «фунт» (мера веса), но чаще — «деньги», «капитал», «основание». Отсюда глагол «фундувати» — «основывать, учреждать, жертвовать средства». В польском языке, который сильно повлиял на западные земли Российской империи, fundować — «финансировать, содержать». Таким образом, Фундовная могла быть прозвищем человека, который что-то «фундовал»: жертвовал на церковь, основывал село или просто был состоятельным.

Суффикс -н- в основе указывает на прилагательное, а окончание -ая — на принадлежность к женскому роду в исходной форме. В отличие от типичных русских фамилий на -ов/-ев, эта модель образования (от прозвища-прилагательного) чаще встречалась в среде казачества и мещанства южных губерний. Фамилия могла возникнуть в среде ремесленников или торговцев, где прозвище, данное по действию или качеству, становилось родовым именем.

Встречается фамилия в основном на юге России и в Украине — в записях XIX века упоминаются крестьяне и мещане с такой фамилией в Харьковской, Екатеринославской губерниях. В современных справочниках она редкая, что говорит о локальном происхождении и малой распространенности. Если искать корни, стоит обратить внимание на документы по Слобожанщине и Приднепровью — там «фунд» как основа фамилий встречается чаще, например, в фамилиях Фундовый, Фундуклеев.

Версия о происхождении от слова «фундамент» маловероятна: это позднее заимствование, которое не дало прозвищ в народной среде. А вот «фундовать» — живое слово диалектов, и фамилия Фундовная — прямое указание на то, что предок был человеком, который «клал основу»: строил, жертвовал, учреждал.