Фамилия Гафанова — женская форма фамилии Гафанов. В русской традиции фамилии на -ов/-ев образуются от мужских личных имён, прозвищ или профессий, и Гафанов здесь не исключение. Основа «Гафан» восходит к арабскому имени Гафан (или Гаффан), которое в переводе означает «прощающий», «милостивый» — один из эпитетов Аллаха. В мусульманской среде такие имена давали в знак благочестия, и они нередко становились основой для фамилий у татар, башкир, народов Кавказа и Средней Азии.

Интересная особенность — суффикс -ов, а не -ин, хотя основа оканчивается на -н. В русской ономастике фамилии от имён на -а, -я обычно получают суффикс -ин (например, Гаврила — Гаврилин). Но здесь работает другое правило: если имя или прозвище заимствовано и в исходном языке не склоняется как русское слово на -а, то при адаптации часто использовали -ов. «Гафан» воспринималось как мужское имя твёрдого склонения, отсюда и Гафанов. Это отличает фамилию от, скажем, Гафанин, которая могла бы возникни от формы Гафаня.

Географически фамилия Гафанов (и Гафанова) чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, а также среди азербайджанцев и дагестанских народов. Встречается она и в русских регионах Поволжья, что объясняется многовековыми контактами и смешанными браками. Носители фамилии, скорее всего, потомки людей, чьи предки носили имя Гафан — возможно, муллы, торговцы или ремесленники, но точное сословие без генеалогического исследования установить сложно.

В написании возможны варианты: Гафанова, реже Гаффанова (с удвоенной «ф»), что указывает на прямое заимствование из арабского через тюркские языки. Если ваша фамилия пишется через одну «ф», это более русифицированный вариант, упрощённый при записи в метриках или паспортах.