Фамилия Гагахова — женская форма фамилии Гагахов, и её происхождение уводит нас в мир тюркских языков и прозвищ. Основа фамилии — слово «гага» или «гагах» — скорее всего, восходит к тюркскому корню «кака» или «гага», что означает «дед», «предок» или, в некоторых диалектах, «старший брат» или «дядя». В тюркской ономастике (науке об именах) такие прозвища часто давали уважаемому старшему члену рода, человеку с авторитетом. Суффикс «-ов» в мужской форме Гагахов — типичный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность: «сын Гагаха». Фамилия Гагахова, таким образом, означает «дочь или жена того, кого звали Гагахом».

Словообразовательная модель здесь проста, но необычна: корень «гагах» — редкое для славянских фамилий заимствование, а суффикс «-ов» — стандартный русский способ адаптации. В отличие, скажем, от фамилий на «-ин» (которые чаще образуются от основ на -а, -я), здесь мы видим основу на согласный, что типично для фамилий, возникших из прозвищ, а не из крестильных имён. Встречаются однокоренные фамилии: Гагарин (от «гагара» — птица или «гага» — крикливый человек), но Гагахов — совсем другой ряд, скорее всего, не связанный с птицами.

Географически фамилия Гагахова редка и, судя по данным переписей, сосредоточена в регионах с тюркским населением или давними контактами с тюрками: Поволжье (Татарстан, Башкирия), Северный Кавказ, а также в казачьих областях (Оренбуржье, Ставрополье). Это наводит на мысль, что предок носителя фамилии мог быть татарином, башкиром, ногайцем или представителем другого тюркского народа, который принял православие и получил русскую фамилию. В XIX веке такие фамилии нередко давались при крещении инородцев, причём прозвище могло быть записано со слуха, отсюда и вариант «Гагах» вместо более привычного «Гага» или «Кака».

Сословная принадлежность по фамилии не определяется: Гагаховы могли быть и крестьянами, и казаками, и мещанами. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия встречается эпизодически, но без указания на дворянство. Современные носители фамилии Гагахова — это, скорее всего, потомки тех самых тюркских переселенцев или крещёных татар, которые сохранили в фамилии память о родовом прозвище предка.