Фамилия Гаипов образована от личного имени Гаип. В основе лежит арабское слово «гаиб» — «скрытый», «невидимый», «тайный». В исламской традиции это один из эпитетов, указывающих на знание сокровенного, того, что недоступно обычному человеку. Имя Гаип давали с пожеланием, чтобы ребенок обладал глубоким пониманием мира или был защищен от дурного глаза.

Словообразовательная модель проста: к имени Гаип добавили русский патронимический суффикс -ов. Так в среде тюркских народов, исповедующих ислам, появлялись фамилии, адаптированные к российской делопроизводственной традиции. Окончание -ов указывает на принадлежность: «сын Гаипа». Это одна из самых распространенных моделей в русском языке, поэтому фамилия органично вписалась в общероссийский именник.

Встречается фамилия в основном у татар, башкир, а также у народов Кавказа и Средней Азии, где имя Гаип было распространено. В дореволюционной переписи населения такие фамилии фиксировались редко — часто их заменяли отчествами или прозвищами. Массово фамилию Гаипов закрепили в советское время, когда паспортизация охватила все национальные окраины.

Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Га́ипов. В разговорной речи встречается вариант Гаи́пов, но он менее точен по отношению к исходному имени. В написании путаницы почти не бывает: буквосочетание «аи» в корне легко опознается, и фамилию редко искажают.

С точки зрения сословной истории, носители фамилии Гаипов не принадлежали к дворянству. В основном это крестьяне, ремесленники или купцы из татарской и башкирской среды. Известных исторических личностей с этой фамилией нет в широких энциклопедиях, но она нередка в среде сельской интеллигенции: учителей, врачей, агрономов.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Гаипов стоит в одном ряду с Гаибовым, Гаиповым (с другим окончанием) и Гаипкуловым. Все они восходят к тому же имени, но различаются по суффиксам и вторым компонентам. Фамилия Гаипов — самая лаконичная и прямая по смыслу.